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肝UDP-葡糖糖基糖基转移酶丰度 - 活性相关性和群体变异的表征使用蛋白质组学方法和细胞色素P450酶的比较

瑞安·h·高桥那威廉F. Forrest.那亚历山大D.史密斯那贾丝廷Badee那NaHong邱那Stephan施密特那Abby C. Collier那尼尔·帕洛特和斯蒂芬福勒
亚博体育app药物代谢和性格 2021年6月29日, dmd - ar - 2021 - 000474; DOI: https://doi.org/10.1124/dmd.121.000474
瑞安·h·高桥
1DMPK,Denali Therapeutics,美国
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威廉F. Forrest.
2Genentech,Inc。,美国
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  • 威廉·f·福雷斯特的ORCID记录
亚历山大D.史密斯
3.加拿大不列颠哥伦比亚省大学制药科学学院
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  • 亚历山大·d·史密斯的ORCID记录
贾丝廷Badee
4.瑞士诺华
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NaHong邱
5.制药研究和早期发展,F.Hoffmann-La Roche Ltd,瑞士
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Stephan施密特
6.美国
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  • 在PubMed上找到这位作者
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Abby C. Collier
7.加拿大不列颠哥伦比亚省的制药科学
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  • 在PubMed上找到这位作者
  • 在此网站上搜索此作者
尼尔·帕洛特
8.Roche,瑞士
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  • 在PubMed上找到这位作者
  • 在此网站上搜索此作者
斯蒂芬福勒
9.亚博体育app药物代谢,F. Hoffmann-La Roche Ltd,瑞士
  • 在Google Scholar上找到这个作者
  • 在PubMed上找到这位作者
  • 在此网站上搜索此作者
  • 这是斯蒂芬·福勒的ORCID记录
  • 对于通信:stephen.fowler@roche.com.
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摘要

使用基于LC-MS / MS的方法测量130个人肝脏微粒体样品中的十个主要药物代谢UDP-葡糖醛糖基转移酶(UGT)酶的表达。同时,还测量了10个细胞色素P450和P450还原酶,并评估了相比之下的活性表达关系。结果数据集展示了,除了UGT2B17,10之外TH.-90TH.UGT表达式的百分位数跨越3至8倍的范围。这些范围相对于报告的平均UGT酶表达在不同实验室的范围内。我们使用选择性探针基板测试UGT表达与酶活性的相关性。对于UGT1As(1A1,3,4,6)和CYP,观察到高度丰度活性(RS> 0.6)。相反,蛋白质丰度和活性对于UGT1A9和UGT2B酶(2B4,7,10,15和17)不相关。对于UGTS 2B7,2B10和2B15,蛋白质丰富强烈地相关。我们建议许多因素可能有助于这些差异,包括探针底物的不完全选择性,这些UGT2b同种型的相关表达,以及接头和多晶型变体对蛋白质组学分析中使用的肽的影响,并在UGT2B10的情况下举例说明这一点。广泛的相关分析确定了验证蛋白质组学的保真度的重要标准和用于评估UGT可变性,人口差异和植入变化的酶促活性方法。

意义陈述蛋白质表达数据允许详细评估个体间的变异和酶个体发生。我们观察到肝内UGT1A酶和p450酶的表达和酶活性有很好的相关性。然而,对于UGT2B家族,在假设表达和活性之间的相关性时,需要注意,这通常是在基于生理的药代动力学模型中所做的。这可能是由于探针底物的特异性不完全,但也可能与无活性UGT蛋白材料的存在和剪接变化的影响有关。

  • 替代拼接/ RNA编辑
  • CYP表达
  • 蛋白质组学分析
  • UDP glucuronosyltransferase (UGT)
  • 版权所有©2020美国药理学和实验治疗学会
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亚博体育app药物新陈代谢和处理:49(6)
亚博体育app药物代谢和性格
卷。49.那问题6.
2021年6月1
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UGT和CYP蛋白质组学丰富活动评估

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亚博体育app药物代谢和性格 2021年6月29日, dmd - ar - 2021 - 000474; DOI: https://doi.org/10.1124/dmd.121.000474

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